Torri'r rhwystr llafar （4）

Darganfod a Deillio'r Peptid Cylchol PTG-200
Darganfod PTG-200

Yn 2016, datgelodd y prif gymeriad batent (WO2016011208) ar gyfer atalydd polypeptid llafar yn targedu IL-23R, a oedd yn cynnwys nifer o ddilyniannau peptid llinol a chylchol a oedd yn gallu rhwymo i IL-23R. Yn nodedig, mae'r dilyniannau a gyflwynir yn Nhabl 3A o'r patent hwn yn debyg iawn i'r strwythurau a gafwyd yn flaenorol gan MDL trwy arddangosiad phage. Mae'r dilyniannau peptid llinol rhestredig yn bennaf yn cynnwys y strwythur craidd -WQDYW- (fel y dangosir yn y ffigur isod). Yn eu plith, cyflawnodd y moleciwl mwyaf cryf (SEQ ID NO.4) grynodiad ataliol IL-23R o 4.1 µM, gyda'i strwythur wedi'i ffurfio trwy asetylu terfynfa N Peptid 23.15 MDL.
Mae'n werth nodi bod MDL a Phrotagonist unwaith wedi negodi cydweithrediad ar y peptid IL-23R yn 2014, pan rannodd MDL ei wybodaeth ymchwil. Yn 2015, llofnododd y ddwy ochr gytundeb cyfrinachedd, ond daeth y trafodaethau i ben ym mis Hydref yr un flwyddyn. Datgelodd dogfennau cyfreithiol dilynol fod MDL wedi ffeilio achos cyfreithiol yn erbyn Prif gymeriad yn Llys Dosbarth yr UD, yn honni torri patent gan PTG-200, yn ymwneud â phatentau US 8946150 (MDL) ac US 9624268 (Protagonist). Yn 2018, gwrthodwyd hawliad torri patent MDL oherwydd bod Protagonist wedi defnyddio'r peptidau hyn i ddatblygu cyffuriau a gymeradwywyd gan FDA ar gyfer clefydau hunanimiwn, a ddiogelwyd o dan y rheol harbwr diogel.

Gan ddychwelyd i ffocws yr erthygl hon, cadwodd y Prif gymeriad y - strwythur craidd WQDYW a gynigiwyd gan MDL mewn addasiadau moleciwlaidd dilynol, ond mabwysiadodd ddyluniadau gwahanol yn y strategaeth seiclo. Fe wnaethon nhw gyflwyno Cys i'r dilyniant craidd i ffurfio strwythur cadw - CXX-WQCYW - (fel - CQTWQCYW -), a deillio cannoedd o beptidau o amgylch y strwythur hwn, gan gynyddu gweithgaredd i lefelau nanomolar (fel y dangosir yn y diagram isod). Yn ogystal, mae'r Protagonist hefyd wedi ceisio dulliau amrywiol o gylchrediad, gan gynnwys cyflwyno bond thioether rhwng dau safle Cys, gan ddefnyddio adwaith metathesis olefin (RCM), a gweithredu strategaethau cylchredeg bond amide. Fodd bynnag, mae canlyniadau arbrofol yn dangos bod peptidau cylchol gan disulfide neu fondiau thioether yn gyffredinol yn arddangos gwell gweithgaredd na pheptidau cylchol gan RCM neu fondiau amid.

Datgelir data PK PTG-200 (cyfansoddyn C) yn y patent: ar ôl ei roi trwy'r geg i lygod mawr ar ddogn o 20 mg/kg, mae'r cyfansoddyn yn cael ei ddosbarthu'n bennaf yn y meinwe gastroberfeddol, gydag amlygiad systemig hynod o isel. Yn eu plith, AUC mwcosa berfeddol bach yw 355 μ g · h / g, a mwcosa'r colon yw 77 μ ​​g · h / g. Fodd bynnag, dim ond 0.3 μ g · h/mL yw'r AUC mewn plasma, gyda chyfradd adferiad o 40% mewn feces. Mae'r cyfansoddyn hwn yn arddangos sefydlogrwydd da mewn amrywiol hylifau gastroberfeddol ac amgylcheddau lleihau: mae ei hanner bywyd yn fwy na 24 awr mewn hylif coluddol efelychiedig (SIF), hylif gastrig efelychiedig (SGF), a hylif berfeddol dynol, ac mae ganddo hefyd hanner oes o dros 2 awr yn yr asiant lleihau DTT. Dangosodd canlyniadau'r arbrawf SPR nad yw'n rhwymo i IL-12R 1 yn unig, ond gall glymu i wyneb IL-23R ac IL-12R 1/IL-23R co wedi'i fynegi, gyda gwerthoedd affinedd cryf a KD o 2.42 nM a 2.56 nM, yn y drefn honno.

Deilliad o PTG-200

Yn 2017, cyhoeddodd Protagonist ei ail batent ar gyfer atalyddion peptid IL-23R (WO2017011820). Mae'r patent hwn yn ymestyn sgerbwd y patent cyntaf gan 227 o ddilyniannau deillio (SEQ ID NO.1030-1256) ac yn cyflwyno unedau strwythurol ar y peptid cylchol a all ymestyn yr hanner oes in vivo (fel y dangosir yn y ffigur canlynol). Mae astudiaethau ffarmacocinetig wedi dangos, ar ôl rhoi 10mg/kg Peptid NO.1185 drwy'r geg i lygod mawr, fod y crynodiad mewn plasma yn llawer is na'r hyn a geir mewn samplau o'r coluddyn bach a'r colon, a bod y gyfradd adfer mewn carthion yn cyrraedd 20% ar ôl 24 awr. Dangosodd y gwerthusiad diogelwch nad oedd Peptide NO.1185 yn arddangos effeithiau ataliol ar 44 targed gan gynnwys derbynyddion cypledig protein G, cludwyr, a sianeli ïon ar 10 µM.

Yn dilyn hynny, cyhoeddodd Protagonist nifer o batentau deilliadol yn seiliedig ar strwythurau PTG-200 neu Peptide NO.1185, a oedd yn gwneud y gorau o weithgaredd a sefydlogrwydd ymhellach trwy ddeilliadau strwythurol mewn gwahanol safleoedd gweddillion. Gellir dod o hyd i fanylion yr addasiadau cysylltiedig mewn patentau WO2018136646, WO2020014646, WO2021007433, a WO2021146458. Yn ogystal, mae Protagonist hefyd wedi gwneud cais am batent (WO2018022937) sy'n cwmpasu atalydd peptid cylchol IL-23R sy'n cynnwys 34 o asidau amino, na fydd yn cael ei drafod ymhellach yn yr erthygl hon.